Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FHOD3Q2V2M9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FHOD3Q2V2M9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms