Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMPQ1L6U9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms