Protein–RNA interactions for Protein: Q16880

UGT8, 2-hydroxyacylsphingosine 1-beta-galactosyltransferase, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UGT8Q16880 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UGT8Q16880 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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UGT8Q16880 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UGT8Q16880 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms