Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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PTPRNQ16849 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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