Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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RTN1Q16799 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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RTN1Q16799 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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RTN1Q16799 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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RTN1Q16799 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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RTN1Q16799 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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