Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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