Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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