Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms