Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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