Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCSK7Q16549 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms