Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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E2F4Q16254 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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E2F4Q16254 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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