Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL1Q16048 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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