Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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