Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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