Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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