Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms