Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TCEA2Q15560 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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