Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NR6A1Q15406 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR6A1Q15406 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms