Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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