Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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