Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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