Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSPNQ14714 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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