Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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