Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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