Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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