Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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