Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR4Q13639 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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HTR4Q13639 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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HTR4Q13639 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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