Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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