Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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