Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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