Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZK1IP1Q13113 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZK1IP1Q13113 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms