Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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