Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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