Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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