Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms