Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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AP1B1Q10567 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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AP1B1Q10567 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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AP1B1Q10567 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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AP1B1Q10567 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP1B1Q10567 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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