Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms