Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms