Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms