Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms