Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNDQ07001 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms