Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms