Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPAQ06546 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms