Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1T1Q06455 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms