Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms