Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ERCC6Q03468 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms