Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms