Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms