Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms