Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms